Alonso Valencia Llano nació en Pácora, municipio del departamento de Caldas. Obtuvo su título de Licenciado en Historia en la Universidad del Valle. Posteriormente, recibió el título de Maestro en Historia con mención en Historia Andina de la Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales (FLACSO) sede Ecuador en el año 1986 . En el año 2003 recibió el Diploma de Estudios Avanzados en Historia de América. 

En 1987 fue nombrado profesor del Departamento de Historia en la Universidad del Valle condición laboral que ha mantenido hasta la actualidad, aunque ha realizado otras actividades académicas y administrativas. Entre ellas, ha sido Jefe del Departamento de Historia, Director del Plan de Ciencias Sociales, Director de la Especialización en la Enseñanza de las Ciencias Sociales e Historia de Colombia, Director de la Maestría en Historia, Vicedecano de Investigaciones de la Facultad de Humanidades y Director del Doctorado en Humanidades en la Universidad del Valle.